More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43398 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_43398  APC family transporter: amino acid  100 
 
 
506 aa  991    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  40.35 
 
 
471 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  40.56 
 
 
471 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  39.48 
 
 
471 aa  319  9e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  39.48 
 
 
471 aa  319  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  41.24 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  38.54 
 
 
489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  43.37 
 
 
471 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  41.29 
 
 
467 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  41.07 
 
 
467 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  41.07 
 
 
467 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  41.07 
 
 
467 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  41.74 
 
 
467 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  41.07 
 
 
467 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  41.12 
 
 
491 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  38.28 
 
 
495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  38.78 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  41.52 
 
 
467 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  41.07 
 
 
467 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 
495 aa  300  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  38.08 
 
 
494 aa  299  9e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  40.36 
 
 
476 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  40.9 
 
 
476 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  38.3 
 
 
492 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  39.11 
 
 
499 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  41.83 
 
 
497 aa  296  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  40.35 
 
 
467 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  37.87 
 
 
500 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  36.96 
 
 
463 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  38.44 
 
 
518 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  38.04 
 
 
488 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  39 
 
 
476 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  36.62 
 
 
490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  36.96 
 
 
463 aa  289  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  36.97 
 
 
471 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  36.97 
 
 
471 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  36.97 
 
 
471 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  36.97 
 
 
471 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  36.97 
 
 
471 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  36.97 
 
 
471 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  36.97 
 
 
471 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  38.27 
 
 
503 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  37.69 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  39.23 
 
 
503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  38.67 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  35.62 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  35.62 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  35.62 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  39.81 
 
 
496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  37.45 
 
 
495 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  37.3 
 
 
471 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 
471 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 
495 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  37.02 
 
 
486 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  39.5 
 
 
460 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  38.55 
 
 
476 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 
504 aa  279  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  40.64 
 
 
483 aa  277  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  35.85 
 
 
512 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  36.15 
 
 
496 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  36.15 
 
 
496 aa  276  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  37.94 
 
 
517 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  37.79 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  35.4 
 
 
471 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  35.4 
 
 
471 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  38.73 
 
 
491 aa  273  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  35.4 
 
 
471 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  35.4 
 
 
471 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  34.96 
 
 
471 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  38.61 
 
 
478 aa  271  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 
686 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  35.54 
 
 
503 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 
515 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  36.81 
 
 
496 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  38.34 
 
 
465 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  38.08 
 
 
469 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  33.76 
 
 
471 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  35.68 
 
 
486 aa  267  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  35.68 
 
 
486 aa  267  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  38.19 
 
 
549 aa  266  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  34.93 
 
 
520 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  39.31 
 
 
481 aa  266  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  36.89 
 
 
471 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  36.65 
 
 
501 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 
493 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  38.66 
 
 
500 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  38.16 
 
 
486 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  36.8 
 
 
502 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  39.33 
 
 
473 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  37.42 
 
 
495 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  34.57 
 
 
516 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  38.83 
 
 
467 aa  263  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  37.86 
 
 
465 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  38.75 
 
 
467 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  38.75 
 
 
467 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  38.75 
 
 
467 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  36.69 
 
 
513 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  37.87 
 
 
466 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 
466 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 
464 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>