More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0606 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 89 aa  173  9e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  66.25 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  63.33 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  66.25 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  66.25 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  66.25 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  68.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  67.12 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  57.47 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0302  50S ribosomal protein L24  63.38 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.659350000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  57.32 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  53.93 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  57.78 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  53.93 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  53.57 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  53.57 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  55.13 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  50.55 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  61.11 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  50 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  51.11 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  51.76 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  50.57 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  54.44 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  53.57 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  50.59 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  50.59 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  52.44 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  58.33 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  55 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  53.09 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  51.19 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  54.93 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  51.19 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  54.32 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  53.66 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  52.27 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  58.54 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  54.32 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  52.63 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  51.19 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  53.09 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  53.09 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  48.78 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  52.63 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  51.81 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  55.06 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50.6 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  46.43 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  52.5 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  57.75 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  53.66 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  53.66 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  51.19 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  51.19 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0500  50S ribosomal protein L24  54.43 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000146538  decreased coverage  0.00101346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  49.44 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0495  50S ribosomal protein L24  54.43 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  52.56 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  56.41 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  58.11 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  51.22 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  55.13 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  55.13 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  40.91 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0437  50S ribosomal protein L24  49.45 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277232  hitchhiker  0.0000906767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  54.43 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  56.96 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  52.63 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  54.65 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  52.63 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  53.16 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  52.33 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  42.05 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  57.75 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  44.32 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  52.81 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>