More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0302 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0302  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 79 aa  148  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.659350000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  63.38 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  64.79 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  58.11 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  63.01 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  58.11 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  60.56 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  60.27 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  55.41 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  55.41 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  54.79 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  52.86 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  53.95 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  55.71 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  46.05 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  46.05 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  44.74 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  44 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  51.47 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  49.33 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  56.34 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  52.05 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  47.3 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  53.62 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  47.3 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  41.89 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  48.68 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  48.68 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  50 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0437  50S ribosomal protein L24  52.86 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277232  hitchhiker  0.0000906767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  50.7 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.095489999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 106 aa  66.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 106 aa  66.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  39.13 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0495  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>