20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1393 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1574  hypothetical protein  72.2 
 
 		 230 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  51.16 
 
 		 245 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3153  tetratricopeptide TPR_2  51.9 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4013  hypothetical protein  33.52 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  28.19 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 468 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 1979 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 486 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  33.72 
 
 		 767 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 452 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1197  fimbrial biogenesis and twitching motility protein  25.41 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1587  hypothetical protein  30.28 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0334262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 594 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  45.1 
 
 		 594 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 410 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>