47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1014 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  81.75 
 
 		 137 aa  230  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  62.31 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  62.02 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  57.03 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  57.64 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  52.31 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  40.31 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  40.87 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  31.75 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  35.29 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  33.86 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  33.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  31.93 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  33.33 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  33.33 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  33.61 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  33.61 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  32.48 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  32.48 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  34.45 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  35.9 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  36.45 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  34.19 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  32.77 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  32.03 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  33.93 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  34.45 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  34.45 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  34.82 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  35.92 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  31.67 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  34.82 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  37.84 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  33.93 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  31.3 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  33.07 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  33.07 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  32.5 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  29.31 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  27.78 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  29.87 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2863  hypothetical protein  29.77 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00114886  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  29.81 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  28.71 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1822  phasin 2  29.13 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>