37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0830 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  73.97 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  50.72 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  44.93 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  44.78 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  43.08 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  41.54 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  53.57 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  44.26 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1443  hypothetical protein  54.76 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  36.92 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  40 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  39.62 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  35.48 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  36.92 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 83 aa  40  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>