199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0978 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  49.14 
 
 
580 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  55.49 
 
 
177 aa  177  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  46.89 
 
 
368 aa  174  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.14 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  33.72 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.65 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.45 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.89 
 
 
211 aa  72  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.89 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.27 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  29.14 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.53 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.57 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.52 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  27.61 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.11 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  31.97 
 
 
393 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  31 
 
 
373 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  28.35 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.53 
 
 
259 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.64 
 
 
233 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.41 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  26.62 
 
 
397 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.08 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.28 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  38.46 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.67 
 
 
216 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.34 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  29.05 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  26.11 
 
 
397 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  26.02 
 
 
208 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  32.26 
 
 
453 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  37.66 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.32 
 
 
211 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.34 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  37.66 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  26.8 
 
 
397 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  26.71 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.43 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.49 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  29.23 
 
 
391 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.29 
 
 
218 aa  57.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.43 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  39.08 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.16 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  32.38 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  38.16 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.25 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  27.44 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  38.16 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  28.88 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  26.32 
 
 
392 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  26.46 
 
 
206 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  26.46 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  26.46 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  26.46 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.46 
 
 
210 aa  55.1  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  26.46 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  35.11 
 
 
208 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.08 
 
 
219 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.91 
 
 
220 aa  54.3  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  38.46 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  38.46 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.33 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  30.71 
 
 
310 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.91 
 
 
310 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  26.46 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  35.11 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.58 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  28.18 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  25.61 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  30.7 
 
 
214 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  38.16 
 
 
152 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  28.7 
 
 
389 aa  51.6  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0063  FMN-binding domain-containing protein  29.08 
 
 
230 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.650559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  39.44 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3236  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.97 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03273  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  32.71 
 
 
261 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  34.02 
 
 
209 aa  51.2  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  32.32 
 
 
208 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  32.32 
 
 
208 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  36 
 
 
209 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  31.43 
 
 
230 aa  51.2  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  32.32 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1691  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.86 
 
 
258 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.517966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  25.41 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0551  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.23 
 
 
318 aa  50.1  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.726956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  30.49 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  21.13 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>