53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0849 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  35.85 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  34.31 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  34.31 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  28.24 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  32.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  34.31 
 
 		 199 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  27.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1335  NERD domain protein  27.68 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.600147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3085  NERD domain protein  26.83 
 
 		 478 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  28.57 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  34.07 
 
 		 185 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  29.17 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  27.01 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  29.88 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  35.05 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  30.28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  29.41 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  31.25 
 
 		 207 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  25 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  36.05 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  21.8 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  32.95 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  23.3 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  28.43 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  28.43 
 
 		 329 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  28.71 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  26.29 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  26.67 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  28 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  28.43 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  27.45 
 
 		 329 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  26.97 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  28.26 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  25 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4790  hypothetical protein  26.17 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5243  nerd domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  26.03 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5192  nerd domain protein  26.17 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  25.14 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  29.63 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  29.11 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  20.81 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  32.93 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  29.11 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4947  hypothetical protein  25.58 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  30.68 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5325  hypothetical protein  25.58 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0019  nerd domain protein  24.32 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.580862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  26.73 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>