More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2826 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  59.84 
 
 		 285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  58.82 
 
 		 260 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  58.94 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  59.02 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  64.26 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  56.8 
 
 		 267 aa  294  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  56.25 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  55.69 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  47.66 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  46.5 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  47.83 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  47.23 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  46.09 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  46.09 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  47.5 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  48.25 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  49.55 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  47.62 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  47.93 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  46.89 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  45.49 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  45.76 
 
 		 270 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  46.96 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  45.76 
 
 		 270 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  45.76 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  46.96 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  48.05 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  45 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  46.75 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  46.75 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  46.75 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  41.6 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  47.52 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  41.84 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  41.84 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  41.84 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  41.84 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  41.98 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  41.42 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  42.63 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  41.56 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  40.91 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  42.68 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  42.68 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  46.28 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  48.7 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  48.7 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  48.7 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  41.8 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  40.24 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  42.67 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  41.38 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  43.31 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  43.27 
 
 		 349 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  43.98 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  42.73 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  48.86 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  39.71 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  41.18 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  40.64 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  47.37 
 
 		 141 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.49 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  31.03 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  33.48 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  31.12 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.39 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  29.86 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.32 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  32.42 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.32 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  32.06 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  30.43 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  32.75 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  32.05 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  30.43 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  28.75 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  29.88 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  30.04 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  28.03 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  28.28 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  33.77 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  30.18 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  30.18 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  33.63 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  32.02 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  33.63 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  29.57 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  29.51 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  27.27 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  28.27 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.96 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  28.89 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  29.03 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  29.37 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  29.78 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>