More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2157 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 
260 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  43.62 
 
 
261 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
262 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
262 aa  201  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
257 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 
271 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 
252 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.53 
 
 
254 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
264 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
263 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 
270 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
254 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
274 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
274 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
265 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
265 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  41.32 
 
 
263 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 
274 aa  148  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
259 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
265 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  30.24 
 
 
266 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  30.12 
 
 
274 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.63 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 
258 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.44 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
263 aa  112  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.47 
 
 
257 aa  111  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1034  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.41 
 
 
636 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 
258 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2506  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
260 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.19 
 
 
260 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
260 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 
257 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 
259 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
265 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.48 
 
 
261 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 
265 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 
265 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.04 
 
 
260 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.13 
 
 
659 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 
265 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
267 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 
257 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.66 
 
 
260 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
262 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
258 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
259 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
261 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  28.92 
 
 
258 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.48 
 
 
650 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
259 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
257 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
259 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 
259 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
268 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.69 
 
 
267 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
258 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  28.46 
 
 
283 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  28 
 
 
256 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 
797 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
257 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.9 
 
 
258 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
259 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
259 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.21 
 
 
260 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.24 
 
 
258 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 
259 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
258 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.32 
 
 
260 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
260 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
262 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  28.35 
 
 
258 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
259 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 
257 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
271 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
264 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 
257 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 
257 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
270 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
256 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 
258 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0400  short chain enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
270 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0904838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>