66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0649 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0649  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0650  hypothetical protein  40.51 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.59 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.74 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.04 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.18 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.04 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.29 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.29 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  50 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  46.67 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.19 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.62 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.62 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1504  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000779378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  32.14 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  38.6 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  46.94 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  32.73 
 
 		 104 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  32.14 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3552  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.578946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1993  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0188  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4563  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.38 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  35.85 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.38 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 257 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.44 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.67 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.44 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  46.67 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.6 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.29 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.85 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.44 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.67 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4116  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2782  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.33 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  44.44 
 
 		 138 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  44.44 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>