48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1729 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  100 
 
 
336 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  29.02 
 
 
437 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  33.12 
 
 
388 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  32.16 
 
 
389 aa  153  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  28.76 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0918  hypothetical protein  29.39 
 
 
312 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.800878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  25.26 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  25 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  23.95 
 
 
434 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  23.72 
 
 
386 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  26.32 
 
 
385 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  24.09 
 
 
379 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  21.4 
 
 
411 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  26.25 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  24.73 
 
 
382 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  24.9 
 
 
427 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  24 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  23.92 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  23.23 
 
 
485 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  23.92 
 
 
416 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  23.92 
 
 
416 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  23.34 
 
 
419 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  24.9 
 
 
374 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  23.1 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  23.1 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  27.4 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  25.58 
 
 
334 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  23.93 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  23.13 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  22.82 
 
 
375 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  26.88 
 
 
422 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  25.47 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  22.92 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  20 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  24.81 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  22.26 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  23.84 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  25.73 
 
 
461 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  26.18 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  29.53 
 
 
390 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  22.07 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  22.88 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  23.97 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  22.94 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  21.29 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  21.29 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  21.29 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  21.31 
 
 
625 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>