More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3555 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  62.06 
 
 
528 aa  647    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
561 aa  1118    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  50 
 
 
513 aa  452  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  48.36 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 
690 aa  402  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.23 
 
 
486 aa  298  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.83 
 
 
491 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.41 
 
 
494 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.53 
 
 
482 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.35 
 
 
482 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.53 
 
 
482 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.35 
 
 
481 aa  252  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.16 
 
 
482 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.16 
 
 
481 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.35 
 
 
481 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.35 
 
 
482 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.16 
 
 
481 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.84 
 
 
500 aa  248  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.07 
 
 
490 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.92 
 
 
482 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 
508 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.35 
 
 
492 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 
508 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.94 
 
 
481 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
508 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.87 
 
 
510 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
520 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.44 
 
 
516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
430 aa  213  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.6 
 
 
451 aa  212  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
507 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.38 
 
 
473 aa  210  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 
499 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.39 
 
 
513 aa  209  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 
514 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
505 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.07 
 
 
484 aa  206  8e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
531 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
501 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.69 
 
 
479 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.87 
 
 
503 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 
489 aa  200  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 
526 aa  196  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
517 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  25.55 
 
 
496 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  25.55 
 
 
496 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 
520 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.04 
 
 
512 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.53 
 
 
453 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
512 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.74 
 
 
492 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 
525 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.74 
 
 
492 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  30.24 
 
 
490 aa  194  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  25.95 
 
 
496 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 
513 aa  193  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
525 aa  193  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  31.81 
 
 
529 aa  193  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  25.18 
 
 
496 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 
620 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
515 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.53 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
514 aa  191  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 
518 aa  191  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  30.92 
 
 
532 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.86 
 
 
510 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.86 
 
 
519 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.94 
 
 
504 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
516 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 
553 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.94 
 
 
510 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.73 
 
 
529 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.86 
 
 
510 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.86 
 
 
510 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  30.87 
 
 
537 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  30.87 
 
 
537 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  30.87 
 
 
537 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
506 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 
510 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.08 
 
 
474 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.4 
 
 
525 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 
510 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 
510 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.39 
 
 
530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 
501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 
501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.49 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.85 
 
 
579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.08 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.29 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  31.23 
 
 
540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.18 
 
 
570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.49 
 
 
510 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>