34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0410 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  100 
 
 
391 aa  788    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  87.98 
 
 
391 aa  699    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  70.66 
 
 
392 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  65.82 
 
 
386 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  55.87 
 
 
387 aa  421  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  39.29 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  41.9 
 
 
395 aa  265  8e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  36.8 
 
 
414 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  37.91 
 
 
380 aa  239  8e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  38.1 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  36.75 
 
 
378 aa  230  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  33.99 
 
 
404 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  34.57 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  34.66 
 
 
388 aa  209  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  30.94 
 
 
389 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  33.5 
 
 
348 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  39.77 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  37.97 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  36.26 
 
 
312 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  34.5 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  34.67 
 
 
330 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  34.2 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  22.93 
 
 
373 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  22.73 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  23.68 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  24.26 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  24.26 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  22.88 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  22.82 
 
 
363 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  22.51 
 
 
357 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  25.46 
 
 
437 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  25.77 
 
 
521 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  24.55 
 
 
458 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  22.1 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>