More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2497 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2497  cytochrome P450  100 
 
 
398 aa  764    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177201  hitchhiker  0.00356568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0387  cytochrome P450  48.96 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00360576  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1493  cytochrome P450  49.6 
 
 
364 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0475912  hitchhiker  0.0000580501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  28.82 
 
 
479 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  25.83 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  27.99 
 
 
454 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.63 
 
 
439 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  29.72 
 
 
429 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  26.35 
 
 
459 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  27.43 
 
 
482 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  35.63 
 
 
452 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.59 
 
 
447 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  28.08 
 
 
441 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  29.52 
 
 
460 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  28.86 
 
 
430 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  27.34 
 
 
479 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  27.45 
 
 
452 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  37.42 
 
 
453 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  37.42 
 
 
474 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  37.42 
 
 
474 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  38.06 
 
 
453 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  47.24 
 
 
429 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27.6 
 
 
1365 aa  96.3  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  25.56 
 
 
451 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  35.98 
 
 
452 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  36.1 
 
 
474 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  27.13 
 
 
461 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  29.12 
 
 
465 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  35.08 
 
 
450 aa  92.8  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  28.25 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  26.87 
 
 
455 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  27.56 
 
 
445 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  33.33 
 
 
462 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  25.69 
 
 
464 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  35.52 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  28.62 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  28.62 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  27.66 
 
 
448 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  29.21 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  28.45 
 
 
448 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.27 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  34.95 
 
 
463 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  25.89 
 
 
473 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  35.71 
 
 
454 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  34.95 
 
 
480 aa  86.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  25.65 
 
 
452 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  24.04 
 
 
463 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  28.66 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  34.43 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  33.73 
 
 
1373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  33.73 
 
 
1373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  33.73 
 
 
1373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  35.58 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  33.73 
 
 
1380 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  39.72 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  25.94 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  33.73 
 
 
1373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  33.73 
 
 
1373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  33.73 
 
 
1373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  33.73 
 
 
1373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  26.28 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  24.42 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  36 
 
 
452 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  27.61 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.27 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  31.36 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  28.86 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  23 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.78 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  25.93 
 
 
468 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  29.31 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  27.84 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  32.02 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  35.84 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  31.21 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  34.43 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  36.21 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  35.26 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  24.93 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16780  hypothetical protein  31.77 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  32.6 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0814  cytochrome P450  37.59 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  29.15 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  33.8 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4342  Cytochrome P450-like protein  32.32 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  33.16 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  24.93 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  36.36 
 
 
468 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  32.99 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  37.5 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  22.73 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  24.22 
 
 
473 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1460  hypothetical protein  31.75 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  38.17 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  25.93 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.4 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  27.83 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.95 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  33.12 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  27.87 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>