More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2114 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  63.31 
 
 		 729 aa  924    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  62.48 
 
 		 724 aa  900    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  100 
 
 		 726 aa  1468    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  50.14 
 
 		 727 aa  748    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  64.11 
 
 		 714 aa  887    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  72.59 
 
 		 726 aa  1075    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  63.03 
 
 		 729 aa  920    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  64.28 
 
 		 728 aa  910    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  36.4 
 
 		 675 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  33.66 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  30.05 
 
 		 791 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  32.77 
 
 		 680 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  28.39 
 
 		 659 aa  263  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  29.55 
 
 		 823 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  30.81 
 
 		 657 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  31.18 
 
 		 710 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  33.67 
 
 		 666 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  28.16 
 
 		 659 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  28.13 
 
 		 658 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  27.87 
 
 		 659 aa  241  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  34.06 
 
 		 617 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  30.47 
 
 		 736 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  26.97 
 
 		 668 aa  231  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  29.92 
 
 		 678 aa  228  3e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  30.32 
 
 		 702 aa  224  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2363  dehydrogenase E1 component  41.08 
 
 		 332 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.706778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1796  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  40.19 
 
 		 348 aa  221  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281194  hitchhiker  0.0011937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1603  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.91 
 
 		 348 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2033  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.8 
 
 		 328 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1630  dehydrogenase, E1 component  38.34 
 
 		 360 aa  210  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0754823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3019  dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunits  28.73 
 
 		 652 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  36.92 
 
 		 324 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  38.65 
 
 		 327 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3050  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.94 
 
 		 332 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1908  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  37.88 
 
 		 381 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  38.58 
 
 		 324 aa  203  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  38.23 
 
 		 327 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1079  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  39.69 
 
 		 337 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.846482 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0878  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, alpha subunit  37.62 
 
 		 322 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00306772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2059  dehydrogenase E1 component  38.02 
 
 		 346 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  37.92 
 
 		 327 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4117  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.16 
 
 		 345 aa  200  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3141  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  36.84 
 
 		 341 aa  200  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  37.05 
 
 		 467 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  36.78 
 
 		 325 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0584  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.53 
 
 		 338 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.576457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1076  dehydrogenase E1 component  39.2 
 
 		 348 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  35.67 
 
 		 327 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  35.67 
 
 		 327 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  34.57 
 
 		 325 aa  196  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1036  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, alpha subunit  36.72 
 
 		 323 aa  195  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0124954  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4985  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.58 
 
 		 325 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1505  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  36.28 
 
 		 345 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1944  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  36.97 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  36.28 
 
 		 328 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0534  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha  35.96 
 
 		 339 aa  194  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  36.39 
 
 		 327 aa  194  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6515  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.25 
 
 		 346 aa  194  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1149  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.79 
 
 		 329 aa  194  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4047  pyruvate dehydrogenase E1 component, alpha subunit  38.79 
 
 		 329 aa  194  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0710149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2588  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  36.42 
 
 		 332 aa  193  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2776  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  36.42 
 
 		 332 aa  193  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2505  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  37.92 
 
 		 332 aa  193  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1224  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.46 
 
 		 376 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42946  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0029  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  33.55 
 
 		 320 aa  193  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2804  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.92 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2780  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  36.42 
 
 		 332 aa  193  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0316753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  35.95 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0988  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.16 
 
 		 361 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0916856  normal  0.876159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2909  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.16 
 
 		 349 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2825  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.92 
 
 		 332 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2539  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  37.58 
 
 		 332 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  36.39 
 
 		 327 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  36.39 
 
 		 327 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  37.35 
 
 		 332 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  36.47 
 
 		 328 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2578  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  36.42 
 
 		 332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000958625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1434  dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 327 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5896  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.08 
 
 		 346 aa  191  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.766336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  38.08 
 
 		 320 aa  191  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  37.92 
 
 		 326 aa  191  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3772  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  33.88 
 
 		 320 aa  191  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2158  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha  38.15 
 
 		 331 aa  190  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  34.37 
 
 		 325 aa  190  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5154  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  36.45 
 
 		 360 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  36.09 
 
 		 324 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1094  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.48 
 
 		 329 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  36.17 
 
 		 328 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  35.54 
 
 		 330 aa  189  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2487  dehydrogenase, E1 component  42.11 
 
 		 323 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2670  dehydrogenase E1 component  40.62 
 
 		 323 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000432402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2760  dehydrogenase, E1 component  37.7 
 
 		 325 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0525  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  37.08 
 
 		 356 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  38.56 
 
 		 327 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5140  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  37.61 
 
 		 327 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215052  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  34.86 
 
 		 328 aa  188  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  38.23 
 
 		 326 aa  188  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0416  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase alpha subunit  34.57 
 
 		 326 aa  187  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  35.37 
 
 		 324 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  35.37 
 
 		 324 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>