More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1151 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1151  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 462 aa  913    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2035  sodium:dicarboxylate symporter  60.09 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4696  sodium:dicarboxylate symporter  62.39 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3595  sodium:dicarboxylate symporter  60.8 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4176  sodium:dicarboxylate symporter  62.47 
 
 		 458 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4398  sodium:dicarboxylate symporter  62.47 
 
 		 458 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.371032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4242  sodium:dicarboxylate symporter  62.47 
 
 		 458 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2257  sodium:dicarboxylate symporter  61.16 
 
 		 480 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1530  sodium:dicarboxylate symporter  60.59 
 
 		 447 aa  511  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14090  Na+/H+ dicarboxylate symporter  58.61 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0515  sodium:dicarboxylate symporter  61.63 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12470  C4-dicarboxylate-transport transmembrane protein dctA  63.78 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000112965  normal  0.468054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1530  sodium:dicarboxylate symporter  61.36 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000123662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25740  Na+/H+ dicarboxylate symporter  58.96 
 
 		 456 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1323  sodium:dicarboxylate symporter  61.82 
 
 		 464 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3870  sodium:dicarboxylate symporter  58.6 
 
 		 444 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137849  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  44.93 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4205  C4-dicarboxylate transport protein  48.07 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  47.13 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  47.58 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  47.49 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.36 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.92 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.36 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  47.99 
 
 		 445 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.69 
 
 		 440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  48.11 
 
 		 445 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.69 
 
 		 440 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.69 
 
 		 440 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.14 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  45.65 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  47.07 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.65 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.65 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.65 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.65 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.65 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.72 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  45.65 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  46.68 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  45.65 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.41 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  44.47 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  46.34 
 
 		 447 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  45.05 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  45.01 
 
 		 446 aa  352  8e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.75 
 
 		 449 aa  352  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  46.34 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5694  sodium:dicarboxylate symporter  43.68 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  45.07 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.52 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.21 
 
 		 443 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.63 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.4 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.17 
 
 		 428 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  42.96 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.89 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.14 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.14 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.14 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.81 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.14 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.14 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.76 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2234  sodium:dicarboxylate symporter  45.41 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.94 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.35 
 
 		 429 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.69 
 
 		 442 aa  342  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.74 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  43.82 
 
 		 449 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  45.56 
 
 		 449 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.26 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.69 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.37 
 
 		 444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.02 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.94 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.89 
 
 		 452 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3546  sodium:dicarboxylate symporter  42.57 
 
 		 509 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.45 
 
 		 439 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  44.8 
 
 		 448 aa  335  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.17 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.17 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.17 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  45.18 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  45.09 
 
 		 434 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1244  sodium:dicarboxylate symporter  44.8 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.63 
 
 		 447 aa  332  9e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  44.34 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.66 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  43.93 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  43.93 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  41.41 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  43.93 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.89 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  46 
 
 		 447 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  44.11 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.37 
 
 		 429 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.89 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  45.54 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.86 
 
 		 429 aa  325  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>