More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0737 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0737  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 409 aa  840    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.578074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 490 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 473 aa  338  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 474 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 474 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 496 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 473 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 473 aa  328  8e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 474 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 474 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 466 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 469 aa  319  7e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 475 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 487 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 476 aa  312  5.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 465 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 473 aa  312  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 474 aa  309  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 467 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 463 aa  298  9e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 509 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 459 aa  296  3e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 475 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 464 aa  292  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 474 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1950  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 473 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 472 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 469 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 471 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 466 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3757  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00456424  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 471 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 471 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 475 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 469 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 471 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 471 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 471 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  35.57 
 
 		 471 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 471 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 471 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 470 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>