More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0287 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  52.89 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 123 aa  138  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  54.17 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  52.73 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  53.45 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  53.45 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  52.89 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  52.89 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  51.72 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  51.72 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  51.72 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  50.83 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  50.86 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  50.86 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  51.35 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  50.86 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  52.21 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  52.5 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  52.73 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  52.21 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  54.05 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  54.05 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  47.11 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  47.11 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  47.11 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  47.11 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  47.93 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  50.86 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  48.36 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0180  30S ribosomal protein S13  49.14 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000423158  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  49.18 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  49.09 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  50.88 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  47.11 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0206  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000458575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  50.91 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  49.17 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2303  30S ribosomal protein S13  49.12 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0732212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  47.54 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  49.17 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  48.33 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  50.89 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  47.54 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2147  30S ribosomal protein S13  50.44 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0234905  normal  0.437789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  47.93 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  49.09 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  48.33 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2272  30S ribosomal protein S13  50.89 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00112148  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  45.83 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0316  30S ribosomal protein S13  49.09 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0714162  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0235  30S ribosomal protein S13  49.14 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000771174  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  48.76 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  47.93 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0192  30S ribosomal protein S13  49.09 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0218  30S ribosomal protein S13  49.09 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000881294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>