More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5575 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  87.03 
 
 
296 aa  511  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  79.18 
 
 
293 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  79.18 
 
 
293 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  78.5 
 
 
293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  61.09 
 
 
309 aa  342  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  61.04 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  61.9 
 
 
298 aa  335  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  60 
 
 
297 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  64.69 
 
 
285 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
311 aa  320  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  50.47 
 
 
316 aa  262  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02670  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  46.33 
 
 
323 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  46.01 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  42.6 
 
 
311 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
317 aa  209  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
318 aa  206  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  44.69 
 
 
323 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.84 
 
 
310 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.79 
 
 
313 aa  202  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.17 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.25 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  42.42 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  45.45 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  49.43 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.1 
 
 
314 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.88 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.91 
 
 
331 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
301 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  40 
 
 
373 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.69 
 
 
330 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  42.69 
 
 
309 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  44.61 
 
 
283 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  45.17 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.7 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
479 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
504 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.65 
 
 
314 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.01 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.64 
 
 
295 aa  179  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.35 
 
 
321 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.35 
 
 
394 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000116518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
535 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.27 
 
 
315 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1006  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.35 
 
 
384 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000329322  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
477 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.6 
 
 
303 aa  175  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.34 
 
 
298 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.34 
 
 
298 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.51 
 
 
295 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000687127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  41.79 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  39.1 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  42.26 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
469 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.55 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.94 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
485 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.06 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
473 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.11 
 
 
300 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.53 
 
 
298 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.11 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000548174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
472 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.03 
 
 
352 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
475 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.05 
 
 
296 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
470 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  41.76 
 
 
313 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
491 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
464 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.26 
 
 
296 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.4 
 
 
310 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
466 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
466 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
470 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
467 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
477 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
492 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
466 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
468 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.5 
 
 
298 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
464 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 
474 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
465 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
494 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
463 aa  169  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.62 
 
 
298 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
467 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3986  glutamate--tRNA ligase  41.3 
 
 
303 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000239485  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
469 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
466 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
466 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
474 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
463 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
469 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.67 
 
 
299 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>