42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5220 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  87.35 
 
 		 332 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  79.88 
 
 		 338 aa  547  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  79.88 
 
 		 338 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  79.88 
 
 		 338 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  76.05 
 
 		 334 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  56.83 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  57.41 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  54.26 
 
 		 320 aa  355  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  54.23 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  54.55 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  44.05 
 
 		 335 aa  271  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  45.43 
 
 		 309 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  47.02 
 
 		 295 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  37.29 
 
 		 135 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  27.5 
 
 		 165 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  23.6 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  35.35 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  34.86 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  28.68 
 
 		 165 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.91 
 
 		 130 aa  49.7  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  30.28 
 
 		 123 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29.36 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  31.96 
 
 		 141 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.65 
 
 		 138 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  28.3 
 
 		 177 aa  46.6  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.27 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.37 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  24.04 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.69 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  32.32 
 
 		 129 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  29.84 
 
 		 130 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.07 
 
 		 129 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  30.39 
 
 		 139 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.32 
 
 		 130 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  27.16 
 
 		 144 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  27.52 
 
 		 132 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>