47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4304 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  244  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  76.61 
 
 
124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  65.35 
 
 
126 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  66.07 
 
 
126 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  66.07 
 
 
126 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  50.46 
 
 
124 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  51.58 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  44.86 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  47.19 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  46.53 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  53.85 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  41.82 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  44.68 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  43.16 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  43.9 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  48.35 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  45.36 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  42.86 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  43.75 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  44.23 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  39.09 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  41.84 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  40.43 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  40.23 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  34.48 
 
 
100 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  26.97 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  28.81 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  31.52 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  34.09 
 
 
108 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  34.88 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  25.32 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  34.62 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  42.19 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  36.05 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>