More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2999 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  83.89 
 
 
422 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
422 aa  828    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  76.01 
 
 
421 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  76.01 
 
 
421 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  76.01 
 
 
421 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  73.05 
 
 
430 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  60.7 
 
 
447 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  60 
 
 
426 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  51.14 
 
 
434 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.89 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36.15 
 
 
415 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  33.8 
 
 
411 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  34.8 
 
 
415 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  36.3 
 
 
419 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  38.15 
 
 
414 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.35 
 
 
401 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  37.44 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 
420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  35.85 
 
 
408 aa  212  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.33 
 
 
408 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.33 
 
 
408 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.11 
 
 
413 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  38.34 
 
 
420 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  36.32 
 
 
420 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  35.01 
 
 
416 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  34.89 
 
 
416 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  35.21 
 
 
416 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  36.93 
 
 
418 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  35.98 
 
 
415 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  35.21 
 
 
416 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  32.71 
 
 
425 aa  203  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  36.09 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  36.47 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  34.56 
 
 
413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.33 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  31.94 
 
 
412 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  32.18 
 
 
412 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  31.83 
 
 
400 aa  196  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  38.56 
 
 
419 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  34.6 
 
 
423 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.1 
 
 
430 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.36 
 
 
413 aa  192  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  34.04 
 
 
424 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  34.73 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  33.88 
 
 
413 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.84 
 
 
424 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  35.75 
 
 
414 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  34.73 
 
 
418 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  34.13 
 
 
424 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  34.13 
 
 
424 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  32.53 
 
 
411 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  34.13 
 
 
424 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 
412 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.43 
 
 
433 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.76 
 
 
419 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  33.89 
 
 
424 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  34.91 
 
 
424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  34.11 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  34.04 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  33.17 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  33.65 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.69 
 
 
431 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.05 
 
 
415 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  37.38 
 
 
408 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  33.41 
 
 
424 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  33.41 
 
 
425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.52 
 
 
429 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  32.94 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  35.7 
 
 
413 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  37.47 
 
 
408 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  31.79 
 
 
430 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  35.05 
 
 
421 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  32.01 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  30.68 
 
 
412 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  30.68 
 
 
412 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  30.68 
 
 
412 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  33.1 
 
 
424 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  30.44 
 
 
412 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  34.35 
 
 
424 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  38.48 
 
 
410 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.79 
 
 
429 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  36.54 
 
 
413 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  35.31 
 
 
431 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.35 
 
 
418 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  29.88 
 
 
412 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  36.71 
 
 
408 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  30.57 
 
 
417 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  29.11 
 
 
406 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  30.44 
 
 
412 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  30.44 
 
 
412 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  29.74 
 
 
412 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  33.64 
 
 
420 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  35.42 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.93 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.65 
 
 
413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  30.26 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  36.13 
 
 
417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  29.79 
 
 
412 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  29.08 
 
 
412 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>