35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1709 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 169 aa  340  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  61.18 
 
 		 173 aa  207  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  61.4 
 
 		 174 aa  207  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  52.05 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  55.92 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  52.73 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  49.69 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  45.86 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  51.18 
 
 		 174 aa  164  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  44.75 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  45.3 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  50.66 
 
 		 205 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  52.63 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  51.63 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  48.72 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  49.67 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  47.37 
 
 		 193 aa  155  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  47.37 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  47.37 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  44.79 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  49.67 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  45.78 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  48.5 
 
 		 165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  46.75 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  48.68 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  41.18 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  40.79 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  39.29 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  33.69 
 
 		 301 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  33.7 
 
 		 297 aa  101  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  35.23 
 
 		 305 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  33.33 
 
 		 304 aa  96.7  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.14 
 
 		 300 aa  93.6  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.14 
 
 		 300 aa  93.6  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  31.93 
 
 		 119 aa  40.8  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>