71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0864 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  120  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  60 
 
 
60 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  55 
 
 
64 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  60.34 
 
 
58 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  58.33 
 
 
64 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  55.93 
 
 
59 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  61.82 
 
 
61 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  54.55 
 
 
59 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  47.46 
 
 
59 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  52.94 
 
 
55 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  46.27 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  51.61 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
363 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  45 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  42.19 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  45.76 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 
65 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  48.28 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  37.93 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  44.07 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  40.74 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  44.83 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  44.83 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
322 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
313 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  41.38 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  36.92 
 
 
339 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  43.1 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  48.21 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  36.67 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  40.35 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  43.64 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  40.35 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  40.35 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0224  hypothetical protein  30.3 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166196  decreased coverage  0.00859524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  34.48 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  40.35 
 
 
62 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  40 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  40.68 
 
 
59 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  41.67 
 
 
69 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
314 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
288 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  40 
 
 
58 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  38.33 
 
 
64 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  38.46 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  38.46 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  35.59 
 
 
61 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  40.74 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  42.37 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  41.67 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  40 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  41.82 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  41.82 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  38.98 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  38.46 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  38.46 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  38.46 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  41.82 
 
 
63 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>