66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3277 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  77.6 
 
 
187 aa  301  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93033  predicted protein  40.79 
 
 
263 aa  91.3  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0813304  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.57 
 
 
152 aa  89  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  34.9 
 
 
151 aa  87.8  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4694  AIG2 family protein  27.81 
 
 
237 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  38.71 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  37.4 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  37.4 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  34.73 
 
 
371 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  37.9 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  37.1 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  37.1 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  29.05 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  32.39 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  30.5 
 
 
494 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  31.78 
 
 
276 aa  55.1  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  31.91 
 
 
353 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  32.87 
 
 
358 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  31.91 
 
 
353 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  31.91 
 
 
353 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  30.72 
 
 
367 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00356  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
394 aa  54.3  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  35.76 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  33.8 
 
 
153 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  33.1 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  32.87 
 
 
354 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  30.82 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4028  hypothetical protein  29.41 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0119928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  30.99 
 
 
197 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  30.14 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  30.14 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  30.14 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  30.34 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  32.64 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  30.5 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  29.66 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  26.24 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2566  hypothetical protein  26.17 
 
 
191 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0683138  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4170  hypothetical protein  30.06 
 
 
175 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00792981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4144  hypothetical protein  29.48 
 
 
175 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  29.37 
 
 
268 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13383  predicted protein  30.4 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.823077  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  31.08 
 
 
196 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  30.14 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  30.61 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  30.07 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  31.91 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  26.32 
 
 
125 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  29.93 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  31.03 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  30.99 
 
 
169 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  26.67 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  26 
 
 
163 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  29.08 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  32 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  27.08 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  29.17 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  28.66 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  33.06 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  28.85 
 
 
478 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  28.67 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38526  predicted protein  27.61 
 
 
323 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  27.4 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  27.14 
 
 
133 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  26.39 
 
 
151 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>