17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4170 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4170  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  336  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00792981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4028  hypothetical protein  93.14 
 
 
175 aa  316  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0119928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4144  hypothetical protein  97.14 
 
 
175 aa  307  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  31.61 
 
 
151 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  30.97 
 
 
152 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  30.06 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  29.49 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2566  hypothetical protein  26.06 
 
 
191 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0683138  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93033  predicted protein  31.37 
 
 
263 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0813304  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  25.15 
 
 
183 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  27.39 
 
 
185 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  27.39 
 
 
195 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  28.66 
 
 
367 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  27.75 
 
 
371 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  34.34 
 
 
140 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4694  AIG2 family protein  26.11 
 
 
237 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  23.18 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>