More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2992 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 142 aa  291  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  89.93 
 
 		 140 aa  254  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  78.1 
 
 		 137 aa  225  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  78.57 
 
 		 140 aa  222  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  80.45 
 
 		 138 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  72.54 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  78.46 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  76.92 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  73.38 
 
 		 139 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  76.92 
 
 		 136 aa  213  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  75.38 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  76.15 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  72.54 
 
 		 138 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  79.84 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  73.38 
 
 		 139 aa  205  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  72.46 
 
 		 138 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  72.39 
 
 		 136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  69.85 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  74.22 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  73.39 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 138 aa  195  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  72.8 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  72.8 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  68.84 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  72.8 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  72.58 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  73.39 
 
 		 139 aa  190  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  72.58 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  71.32 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 141 aa  183  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  69.35 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  70.54 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  59.85 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  58.99 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  58.16 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  57.85 
 
 		 178 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  55.64 
 
 		 175 aa  152  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  57.63 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 168 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 184 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  55 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0433  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 		 133 aa  143  9e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  55.81 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  56.91 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  56.2 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  56.2 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  47.89 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  55.83 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  57.63 
 
 		 126 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  53.85 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  56.2 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 133 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>