More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0433 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0433  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  90.77 
 
 
132 aa  243  8e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 
136 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  56.1 
 
 
140 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_002978  WD0657  50S ribosomal protein L17  59.2 
 
 
142 aa  144  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0531891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 
142 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  55.65 
 
 
137 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
138 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
138 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 
138 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  52.42 
 
 
141 aa  139  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
138 aa  137  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 
139 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
138 aa  137  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  52.42 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  53.28 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  50.79 
 
 
140 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  53.28 
 
 
140 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  53.28 
 
 
139 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 
141 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 
139 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  53.66 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 
141 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
142 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  53.97 
 
 
131 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  53.97 
 
 
131 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  52.46 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  54.92 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  54.92 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  51.11 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 
127 aa  131  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
140 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  54.1 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  52.42 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 
140 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  50.79 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
132 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 
138 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  50.79 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  50 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  51.64 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  48.09 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
130 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 
130 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 
132 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 
130 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 
146 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
140 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  53.28 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
129 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
129 aa  124  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 
131 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
129 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 
128 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  123  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  123  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  123  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 
128 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  123  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  123  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  123  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  123  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 
127 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>