More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2529 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  93.99 
 
 		 233 aa  444  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  93.94 
 
 		 233 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  93.94 
 
 		 233 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  92.7 
 
 		 233 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  91.42 
 
 		 233 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.42 
 
 		 233 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.42 
 
 		 233 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  93.27 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  89.27 
 
 		 233 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  89.27 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  89.27 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  89.27 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  89.27 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  89.27 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  89.27 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.52 
 
 		 233 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  91.52 
 
 		 233 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.52 
 
 		 233 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  88.84 
 
 		 233 aa  417  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  91.07 
 
 		 249 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  87.01 
 
 		 233 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  87.12 
 
 		 232 aa  407  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  87.12 
 
 		 232 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  87.12 
 
 		 232 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  82.83 
 
 		 233 aa  398  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  86.61 
 
 		 235 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  83.04 
 
 		 231 aa  387  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  80.69 
 
 		 231 aa  384  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  79.4 
 
 		 233 aa  380  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  81.25 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  78.07 
 
 		 237 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  78.07 
 
 		 237 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  79.39 
 
 		 235 aa  371  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  77.63 
 
 		 237 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  77.09 
 
 		 239 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  79.11 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  76.79 
 
 		 237 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  72.77 
 
 		 233 aa  346  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  69.91 
 
 		 239 aa  324  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  55.65 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  54.94 
 
 		 266 aa  255  4e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  54.94 
 
 		 265 aa  255  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4096  two component transcriptional regulator  69.83 
 
 		 184 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  42.92 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  39.55 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 219 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  40.27 
 
 		 219 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  39.46 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  39.9 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  37.44 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.01 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  38.46 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.01 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.67 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.22 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.56 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3276  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2676  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0042  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.12 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>