48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1663 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  47.12 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  43.98 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  46.07 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  49.41 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  45 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  44.25 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  43.92 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  44.57 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  38.74 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  43.75 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  45.31 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  44.79 
 
 		 243 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  44.57 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  43.27 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  44.51 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  37.7 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  36.65 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  36.9 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  40.4 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  40.4 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  37.13 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  35.43 
 
 		 194 aa  94.4  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  35 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  31.52 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  27.37 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  31.01 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  25.56 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  28.69 
 
 		 431 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  26.53 
 
 		 490 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  31.08 
 
 		 476 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  29.71 
 
 		 488 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  29.73 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  25.55 
 
 		 462 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  27.94 
 
 		 492 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  31.58 
 
 		 464 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  38.24 
 
 		 478 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  38.24 
 
 		 478 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  38.24 
 
 		 478 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  29.03 
 
 		 459 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  32.53 
 
 		 431 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  29.63 
 
 		 473 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  33.6 
 
 		 462 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  30 
 
 		 482 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  38 
 
 		 475 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  30.43 
 
 		 421 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>