More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1331 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 389 aa  766    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  71.06 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  63.41 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  57.68 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  60.35 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  57.14 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  56.87 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  59.38 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  57.18 
 
 		 441 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  53.17 
 
 		 498 aa  358  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  52.91 
 
 		 498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  54.34 
 
 		 504 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  57.14 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  54.6 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  58.33 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  56.93 
 
 		 603 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  55.26 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  53.28 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  56.23 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  52.86 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  54.83 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  56.8 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  52.63 
 
 		 509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  57.4 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  55.32 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  47.61 
 
 		 375 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  49.12 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  43.36 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  42.82 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  42.55 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  42.82 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  43.07 
 
 		 373 aa  253  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  46.05 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  40.88 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  41.18 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  44.35 
 
 		 364 aa  239  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  44.38 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  44.23 
 
 		 363 aa  236  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  34.88 
 
 		 300 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.83 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  34.56 
 
 		 300 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  30.86 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  32.31 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  27.93 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  26.36 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 		 510 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  25.62 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.86 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 		 318 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  28.32 
 
 		 549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  31.23 
 
 		 319 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 		 545 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 		 545 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  31.1 
 
 		 307 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  30.37 
 
 		 501 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  34.01 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  32.56 
 
 		 568 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  32.63 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  31.63 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  32.93 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  31.78 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.69 
 
 		 502 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  33.75 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.49 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  31.9 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  34.64 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  31.48 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  32.43 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  32 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27.95 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  32.44 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  24.92 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  31.1 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  27.86 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 		 557 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  28.35 
 
 		 520 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  30.28 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  26.56 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  32.52 
 
 		 308 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  26.99 
 
 		 570 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  31.42 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  27.81 
 
 		 501 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  27.43 
 
 		 548 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  28.79 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  27.41 
 
 		 500 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  26.2 
 
 		 544 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  28.79 
 
 		 500 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  26.63 
 
 		 296 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>