More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0149 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  100 
 
 		 330 aa  681    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  69.4 
 
 		 320 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  68.73 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  68.49 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  67.85 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  64.47 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  67.55 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  67.55 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  67.88 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  67 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  60.98 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  60.98 
 
 		 345 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  58.31 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  60.71 
 
 		 331 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  60.71 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  57.32 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  57.79 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  58.82 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  58.93 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  55.42 
 
 		 332 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  57.28 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  55.26 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  54.69 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  55.37 
 
 		 335 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  54.37 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  56.17 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  55.11 
 
 		 345 aa  361  8e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  55.41 
 
 		 353 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  52.27 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  55.59 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  55.31 
 
 		 342 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  56.35 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  54.22 
 
 		 315 aa  352  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  53.75 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  55.1 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  54.87 
 
 		 335 aa  352  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  54.26 
 
 		 360 aa  351  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  55.25 
 
 		 314 aa  351  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  55.7 
 
 		 350 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  54.22 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  54.22 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  53.9 
 
 		 315 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  53.94 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  55.99 
 
 		 345 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  54.22 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  55.37 
 
 		 350 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  55.37 
 
 		 350 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  55.37 
 
 		 350 aa  350  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  58.88 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  55.52 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  55.41 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  54.22 
 
 		 352 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  54.22 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  53.9 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  55.05 
 
 		 350 aa  348  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  54.46 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  53.9 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  53.94 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  57.47 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  55.66 
 
 		 344 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  54.4 
 
 		 346 aa  348  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  53.31 
 
 		 346 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  54.69 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  54.05 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  54.07 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  54.05 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  54.69 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  56.87 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  54.05 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  54.07 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  54.07 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  54.78 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  53.72 
 
 		 345 aa  346  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  54.89 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  62.06 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  54.07 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  54.07 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  54.07 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  52.19 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  54.07 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  54.05 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  54.07 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  54.22 
 
 		 345 aa  346  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  55.37 
 
 		 354 aa  346  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  55.1 
 
 		 437 aa  346  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  54.72 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  54.72 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  58.06 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  54.72 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  54.72 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  51.28 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  51.28 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  54.89 
 
 		 350 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  53 
 
 		 346 aa  345  7e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1475  biotin synthase  56.03 
 
 		 350 aa  345  7e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  56.09 
 
 		 326 aa  345  8e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  53.72 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  54.98 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  55.26 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  54.72 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>