More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2130 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  56.11 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  39.29 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  34.35 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  38.46 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  40.81 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  35.56 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  33.63 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  30.7 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  28.44 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  32.18 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  25.43 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2968  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.4 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  27.19 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  29.46 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  26.41 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  28.57 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  26.24 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  26.24 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.76 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.76 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.76 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.76 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.76 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  27.13 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  28.38 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.76 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  25.86 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  26.24 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.17 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.24 
 
 		 281 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0938  SPP-like hydrolase  30.41 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  27.54 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  24.63 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  25.86 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  26.82 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.25 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.41 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  24.25 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  28.21 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0436  putative HAD superfamily hydrolase  25.64 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  24.42 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 269 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  24 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  28.44 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  26.14 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  26.14 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.02 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  26.14 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.94 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  24.72 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  21.53 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  28.32 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  23.99 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  25.48 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  21.61 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  25.76 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  25.48 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  25.31 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  26.04 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  25.76 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  24.48 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0905  HAD hydrolase, family IIB  23.4 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  22.39 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  25.76 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.56 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  24.23 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  39.08 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  26.62 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  21.98 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  24.53 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  24.53 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  20.08 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  24.53 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  24.53 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  25.71 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  23.25 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  24.53 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  25.4 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  23.65 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  24.54 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  25.88 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.88 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  25.88 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  22.06 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  24.15 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.49 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  25.64 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  24.81 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  24.06 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  25.86 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1156  SPP-like hydrolase  28.5 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>