More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3005 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3005  Rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  0.106826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  55.4 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  26.36 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  26.56 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  28.29 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  47 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  27.41 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  26.15 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  40 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  26.05 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  38.04 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  34.09 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  26.22 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  27 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 113 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  28.34 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  37.08 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0587  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287178  normal  0.0572789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  32.76 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  34.75 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  42.05 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0931  putative rhodanese-like sulfur transferase  28.86 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186948  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  27.97 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  37.08 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.19 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  32.76 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 		 98 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 98 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  33.04 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.36 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  35.29 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.17 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 		 118 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  40.96 
 
 		 105 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  41.25 
 
 		 113 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 459 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  42.53 
 
 		 107 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 101 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 101 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  36.25 
 
 		 101 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 		 123 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  43.33 
 
 		 123 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 101 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  25.96 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 463 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  36.71 
 
 		 101 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 107 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 		 145 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 		 99 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 		 97 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  37.5 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  27.49 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  31.47 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.82 
 
 		 392 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  29.44 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 117 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0747  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  26.09 
 
 		 454 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 142 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  38.27 
 
 		 98 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  38.27 
 
 		 98 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 467 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  33.71 
 
 		 390 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.755733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>