More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1632 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1632  Patatin  100 
 
 		 305 aa  609  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2156  Patatin  60 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.45 
 
 		 263 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  38.11 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  35.88 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.71 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.71 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.27 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.71 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.45 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.33 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.33 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.45 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.33 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.33 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.33 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  33.71 
 
 		 250 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  34.08 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  30.48 
 
 		 256 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  30.8 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  33.08 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  33.33 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.08 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.08 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  32.71 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  33.2 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.72 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  31.95 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  31.72 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.46 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  28.03 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  28.31 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  43.55 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.22 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  30.71 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.33 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  32.21 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.08 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  33.33 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  35.71 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.16 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  33.2 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  37.31 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  37.31 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  30.89 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  28.77 
 
 		 735 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  30.55 
 
 		 729 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  36.6 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  32.54 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  31.58 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.54 
 
 		 767 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.4 
 
 		 754 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  33.6 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  36.51 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.74 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  27.94 
 
 		 751 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.74 
 
 		 748 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.14 
 
 		 737 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.67 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.91 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  37.5 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.88 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  38.02 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  33.99 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  36.9 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29.3 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  35.94 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.27 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  33.99 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  29.11 
 
 		 734 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  30.38 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  34.06 
 
 		 738 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.59 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  32 
 
 		 347 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  28.76 
 
 		 738 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  28.76 
 
 		 737 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  28.76 
 
 		 738 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  28.76 
 
 		 738 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.51 
 
 		 358 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.04 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1920  patatin  32.86 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.63 
 
 		 276 aa  99  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  30.92 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  33.48 
 
 		 707 aa  99  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  29.01 
 
 		 738 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  29.01 
 
 		 738 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  30.23 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  31.56 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1065 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  31.56 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  29.11 
 
 		 738 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.51 
 
 		 474 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.29 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.28 
 
 		 741 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  31.02 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  31.56 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.97 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.97 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  31.42 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.97 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>