239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5387 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  100 
 
 		 89 aa  173  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  70.42 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  69.44 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  68.06 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  63.53 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  72.13 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  64.52 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  74.51 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  60.66 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  66.67 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  50.63 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  63.16 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  63.64 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  59.65 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  57.63 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  59.65 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  63.16 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  55.56 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  51.67 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  55 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  53.45 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  51.67 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  47.46 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  47.46 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  45.59 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  48.33 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  50 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  49.06 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  39.71 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  43.28 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  42.62 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.37 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  35.21 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  49.18 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  35.71 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  37.1 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  36.07 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  40.58 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  45.28 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  41.67 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  40.68 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  45.28 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  35.82 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  36.36 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  38.03 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  40.35 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  29.58 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  35.29 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 186 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  45.28 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  49.15 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  39.39 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  38.89 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  43.4 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  42.86 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  51.06 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  46.43 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  46.3 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  51.06 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  40.98 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  28.24 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  40.98 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  40.98 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.51 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.51 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  46.3 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  40.98 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  35.82 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  47.83 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  38.33 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  37.31 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  41.51 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  38.33 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  38.33 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  37.14 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  41.51 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  37.29 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  35.71 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  48 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  35.53 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  35.82 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  37.14 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  38.96 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  45.65 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  39.62 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  39.62 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  39.13 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>