30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2979 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  51.03 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  51.63 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  51.24 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  43.8 
 
 		 237 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  52.94 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  32.13 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  31.49 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  28.87 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  30.24 
 
 		 293 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  28.42 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  29.14 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  27.57 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  28.46 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  35 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  24.62 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  40.98 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  23.81 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  50 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  40.54 
 
 		 383 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  39.13 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  41.67 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  43.9 
 
 		 1124 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  45.71 
 
 		 361 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  28.99 
 
 		 547 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  32.56 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  32.56 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  32.65 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  36.11 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>