69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0373 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  830    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  72.6 
 
 		 411 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  73.56 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  73.8 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  74.52 
 
 		 411 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  46.63 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  45.19 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1399  hypothetical protein  26.36 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  23.3 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  27.43 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  26.6 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  26.6 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  24.77 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  23.58 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  24.21 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  19.78 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  21.63 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  24.67 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  25.7 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.15 
 
 		 316 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  26.64 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  26.34 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  24.1 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  24.01 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  26.32 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  27.67 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  25.7 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3187  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  24.1 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  24.1 
 
 		 521 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  24.1 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  26.73 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  24.1 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.88 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  26.92 
 
 		 335 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  25.6 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  25.6 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  24.1 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  33.75 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  23.13 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  24.64 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  24.24 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  23.39 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  24.8 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  21.13 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  24.7 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.29 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  23.89 
 
 		 489 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  25.54 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 		 287 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  25.73 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 663 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  23.7 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  25.59 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  25.59 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  22.5 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 287 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.45 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  21.49 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>