27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5234 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  72.01 
 
 
443 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  61.81 
 
 
516 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  60.37 
 
 
519 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  61.81 
 
 
521 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  61.58 
 
 
521 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  62.41 
 
 
478 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  62.66 
 
 
478 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4269  hypothetical protein  32.08 
 
 
433 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  28.33 
 
 
584 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  28.29 
 
 
584 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  27.3 
 
 
582 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  27.11 
 
 
489 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  26.8 
 
 
424 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  22 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  23.64 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  23.91 
 
 
411 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  22.88 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  21.63 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  22.88 
 
 
411 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  20.11 
 
 
1359 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  25.51 
 
 
316 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  22.26 
 
 
411 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  23.88 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  24.85 
 
 
1209 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.41 
 
 
421 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  31.08 
 
 
239 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>