More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3855 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  76.83 
 
 
425 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3785  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  77.3 
 
 
425 aa  663    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3855  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
414 aa  838    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5236  aminotransferase DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  63.84 
 
 
381 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00401376  normal  0.448242 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2877  aminotransferase  63.66 
 
 
382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0095  aminotransferase  63.66 
 
 
382 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.325267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3874  aminotransferase  63.66 
 
 
382 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3956  aminotransferase  63.66 
 
 
382 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1667  aminotransferase  63.66 
 
 
382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481057  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3098  aminotransferase  63.66 
 
 
382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12825  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3452  aminotransferase  63.66 
 
 
382 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00530807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0219  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  62.64 
 
 
380 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0099  putative transferase  63.84 
 
 
381 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3836  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  63.56 
 
 
385 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.040066  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2870  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  60.66 
 
 
382 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0237  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  60.66 
 
 
382 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0766  putative transferase  60.22 
 
 
402 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3719  putative transferase  60.65 
 
 
381 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1321  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  62.12 
 
 
369 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0344454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00992  nucleotide sugar transaminase  61.1 
 
 
369 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.431545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06174  nucleotide sugar transaminase  61.1 
 
 
369 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3755  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  61.52 
 
 
373 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1920  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  60.44 
 
 
372 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3211  aminotransferase  59.84 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.647908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4288  nucleotide sugar transaminase  60.66 
 
 
378 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2519  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  60.39 
 
 
386 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1583  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  61.05 
 
 
374 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01942  VioA, involved in dTDP-N-acetylviosamine synthesis  57.49 
 
 
370 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.423599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01931  hypothetical protein  57.49 
 
 
370 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.572113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2568  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  57.42 
 
 
369 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1194  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.68 
 
 
383 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325962  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0551  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  49.32 
 
 
383 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0374112  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0937  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.23 
 
 
365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4046  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.03 
 
 
360 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.565912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0323  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.78 
 
 
357 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2773  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.29 
 
 
360 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2572  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.62 
 
 
369 aa  289  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0129477  normal  0.660703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3021  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  44.09 
 
 
394 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.69 
 
 
373 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0236655  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3439  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  42.58 
 
 
373 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0224902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2332  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.09 
 
 
404 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00680217  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2596  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.8 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.148633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2350  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.56 
 
 
423 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2390  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.97 
 
 
407 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144786  hitchhiker  0.00000571481 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0826  aminotransferase  35.34 
 
 
364 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3185  polysaccharide biosynthesis protein  36.64 
 
 
358 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.13 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.71 
 
 
1023 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.53 
 
 
378 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.71 
 
 
370 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2552  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.29 
 
 
1003 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0229  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.62 
 
 
389 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00533175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0362  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.18 
 
 
392 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350885  normal  0.854352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.54 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.87 
 
 
724 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0356  glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.76 
 
 
371 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2125  aminotransferase  38.14 
 
 
393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.9 
 
 
387 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.297651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.88 
 
 
363 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.85 
 
 
364 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.97 
 
 
391 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1489  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.81 
 
 
383 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1483  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.43 
 
 
365 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.14 
 
 
383 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.14 
 
 
383 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2511  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.53 
 
 
393 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.16 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.25 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0240  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.57 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3545  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.44 
 
 
377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2351  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.47 
 
 
366 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4322  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.34 
 
 
392 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.56 
 
 
372 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5160  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.04 
 
 
404 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1801  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.77 
 
 
383 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0709  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.06 
 
 
368 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  33.72 
 
 
360 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2204  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.04 
 
 
374 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1197  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.19 
 
 
386 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.223497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.59 
 
 
368 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1258  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.22 
 
 
386 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6220  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.68 
 
 
404 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1859  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.68 
 
 
404 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1883  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.68 
 
 
404 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296858  hitchhiker  0.00000301203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0926  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.11 
 
 
383 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0698144  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0245  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.72 
 
 
357 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.4037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1414  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.22 
 
 
383 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.405944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1390  aminotransferase  34.67 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.641714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1131  aminotransferase  34.91 
 
 
386 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.28736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1506  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.03 
 
 
535 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2237  aminotransferase  34.67 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3108  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  31.85 
 
 
388 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.787533  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2386  putative glutamine-scyllo-inositol transaminase, LPS biosynthesis-related  33.51 
 
 
383 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2275  aminotransferase  34.67 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1406  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.55 
 
 
373 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0017  aminotransferase  34.67 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.851426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4290  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.97 
 
 
367 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1152  aminotransferase  34.67 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1880  aminotransferase  34.67 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1322  putative aminotransferase protein  35.62 
 
 
386 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>