More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0061 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
391 aa  776    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  82.1 
 
 
391 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  82.18 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  64.12 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  55.12 
 
 
381 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  50.26 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0060  glycosyltransferase  100 
 
 
174 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  46.15 
 
 
389 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  48.84 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  48.71 
 
 
422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  47.49 
 
 
391 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  43.88 
 
 
390 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4687  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 
370 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6665  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1218  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  41.76 
 
 
1915 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  41.76 
 
 
609 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
1089 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 
1241 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 
417 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  33.16 
 
 
375 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  33.16 
 
 
375 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
398 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.92 
 
 
351 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
420 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
384 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
386 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
366 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
369 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
394 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
381 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  38.8 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
395 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  35.02 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
1229 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.49 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
1398 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  38.57 
 
 
846 aa  93.2  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
846 aa  93.2  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
1028 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
770 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
1241 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.73 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  26.85 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  37.73 
 
 
859 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  37.73 
 
 
860 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.37 
 
 
379 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
1261 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
371 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 
838 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
364 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
382 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.66 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
810 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.35 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
448 aa  87  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
376 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>