221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3410 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  64.4 
 
 
206 aa  242  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  57.35 
 
 
203 aa  235  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  50 
 
 
206 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  48.97 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  41.92 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  35.33 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  35.93 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  36.9 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  35.15 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  36.36 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  32.85 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  33.73 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  34.59 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  33.53 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  35.12 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  33.53 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  35.33 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  36.47 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  34.13 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  24.29 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  35.15 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  35.12 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  34.55 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  34.55 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  28.77 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  24.29 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  33.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  35.33 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  31.39 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  23.57 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  23.57 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  26.9 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  26.9 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  29.2 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  31.54 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.54 
 
 
541 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  32.95 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  32.59 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  31.25 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  26.95 
 
 
541 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  26.95 
 
 
541 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.95 
 
 
541 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  27.91 
 
 
283 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  29.26 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  26.35 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  22.86 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  29.81 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  32.14 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  25 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  30.53 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  25.14 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  30.86 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
221 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  30.46 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  21.39 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
197 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
243 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  24.04 
 
 
216 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  35.04 
 
 
419 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  28.4 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  24.31 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4877  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  24.84 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4966  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  24.84 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5245  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654942  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  27.49 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.94 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  30.11 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13730  hypothetical protein  28.04 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.735974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  27.08 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>