57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2431 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  100 
 
 		 137 aa  286  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  57.93 
 
 		 145 aa  167  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  68.1 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  42.14 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  47.01 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  44.64 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  42.61 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  43.48 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  42.37 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  42.37 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  40.87 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  37.72 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  32.48 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  31.97 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  33.33 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  33.86 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  26.96 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  30 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  25.22 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  29.45 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  30.72 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  25.66 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  31.75 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  27.12 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  30.87 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  29.29 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  30.09 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  29.03 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  31 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  27.83 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  28.04 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  30.92 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  24.78 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  26.83 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  29.07 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  27.78 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  30.3 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  23.68 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  26.28 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  29.89 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  24.79 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  25.17 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  21.85 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  28.85 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  27.59 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  28.45 
 
 		 180 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  26.67 
 
 		 124 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  28.57 
 
 		 270 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>