More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2190 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
316 aa  659    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.14 
 
 
287 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  33.33 
 
 
319 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  32.7 
 
 
319 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
664 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
330 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
328 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
323 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
309 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.56 
 
 
330 aa  129  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.3 
 
 
336 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
284 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.99 
 
 
322 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.75 
 
 
320 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.66 
 
 
323 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
328 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.16 
 
 
323 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.31 
 
 
342 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
327 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.02 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.55 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.74 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.79 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
281 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
314 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.2 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.18 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
317 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.19 
 
 
344 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
313 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  25.98 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
329 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
335 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0659  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 
306 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.6 
 
 
318 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
326 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
319 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
328 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
331 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
342 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.92 
 
 
335 aa  106  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.25 
 
 
343 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
313 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
333 aa  106  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3017  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.65 
 
 
340 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0758664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
313 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.84 
 
 
347 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.13 
 
 
310 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
314 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.73 
 
 
307 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
324 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.35 
 
 
322 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
316 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
331 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  26.84 
 
 
308 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
304 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.67 
 
 
367 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.13 
 
 
310 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
310 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.71 
 
 
342 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
345 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.04 
 
 
322 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.04 
 
 
322 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
328 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.66 
 
 
323 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
326 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  27.13 
 
 
323 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.65 
 
 
307 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.16 
 
 
334 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
326 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.98 
 
 
346 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.59 
 
 
330 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.65 
 
 
307 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
330 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.04 
 
 
323 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25.54 
 
 
325 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.05 
 
 
322 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
334 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.93 
 
 
333 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.59 
 
 
340 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.73 
 
 
322 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.73 
 
 
322 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.44 
 
 
307 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.33 
 
 
358 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
310 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.6 
 
 
357 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
304 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
346 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
315 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>