66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7847 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7847    100 
 
 		 189 bp  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0532  acriflavin resistance protein  87.9 
 
 		 3105 bp  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  87.29 
 
 		 3147 bp  115  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0970  acriflavin resistance protein  87.27 
 
 		 3144 bp  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.998572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2095  acriflavin resistance protein  87.27 
 
 		 3162 bp  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238073  normal  0.0214179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  84.48 
 
 		 3147 bp  87.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3972  acriflavin resistance protein  91.04 
 
 		 3138 bp  85.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1597  acriflavin resistance protein  83.33 
 
 		 3135 bp  83.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1529  acriflavin resistance protein  83.62 
 
 		 3153 bp  79.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  92.73 
 
 		 3309 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  84.11 
 
 		 3114 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3690  acriflavin resistance protein  86.05 
 
 		 3234 bp  75.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2855  acriflavin resistance protein  83.64 
 
 		 3165 bp  75.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.427735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1079  acriflavin resistance protein  83.64 
 
 		 3120 bp  75.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0757795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  83.65 
 
 		 3120 bp  71.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2105  acriflavin resistance protein  82.76 
 
 		 3114 bp  71.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1170  acriflavin resistance protein  92.31 
 
 		 3309 bp  71.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273811  normal  0.0444118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1171  acriflavin resistance protein  83.65 
 
 		 3120 bp  71.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  83.65 
 
 		 3120 bp  71.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  87.32 
 
 		 3309 bp  69.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  87.32 
 
 		 3309 bp  69.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  86.49 
 
 		 3120 bp  67.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2520  acriflavin resistance protein  84.88 
 
 		 3138 bp  67.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0450532  normal  0.025752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4167  acriflavin resistance protein  81.82 
 
 		 3108 bp  65.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1078  acriflavin resistance protein  90.38 
 
 		 3309 bp  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.204501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  90.38 
 
 		 3309 bp  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2106  acriflavin resistance protein  90.38 
 
 		 3309 bp  63.9  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0938  acriflavin resistance protein  83.7 
 
 		 3120 bp  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0169  acriflavin resistance protein  83.7 
 
 		 3111 bp  63.9  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.78043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  89.09 
 
 		 3114 bp  61.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2448  acriflavin resistance protein  83.72 
 
 		 3138 bp  60  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2801  acriflavin resistance protein  92.86 
 
 		 3099 bp  60  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0747979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  81.2 
 
 		 3126 bp  58  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3004  acriflavin resistance protein  81.03 
 
 		 3165 bp  56  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.969721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3893  multidrug ABC transporter  80.83 
 
 		 3108 bp  56  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  89.36 
 
 		 3105 bp  54  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1168  acriflavin resistance protein  86.44 
 
 		 3117 bp  54  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4318  acriflavin resistance protein  92.31 
 
 		 3126 bp  54  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.329827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  90.48 
 
 		 3099 bp  52  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3584    90.48 
 
 		 3098 bp  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2330  acriflavin resistance protein  90.48 
 
 		 3099 bp  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  82.35 
 
 		 3111 bp  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  82.35 
 
 		 3111 bp  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4747  acriflavin resistance protein  96.55 
 
 		 3126 bp  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201948  normal  0.322043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  84.62 
 
 		 3141 bp  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  82.35 
 
 		 3111 bp  50.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  82.35 
 
 		 3111 bp  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5637    90 
 
 		 160 bp  48.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  90 
 
 		 3111 bp  48.1  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14340  acriflavin resistance protein AcrB/AcrD/AcrF family  91.43 
 
 		 3114 bp  46.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4152  acriflavin resistance protein  88.37 
 
 		 3120 bp  46.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2754    89.74 
 
 		 3112 bp  46.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  91.43 
 
 		 3312 bp  46.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2744  acriflavin resistance protein  91.43 
 
 		 3315 bp  46.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  85.45 
 
 		 3303 bp  46.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4295  acriflavin resistance protein  91.43 
 
 		 3135 bp  46.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0855426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3611  acriflavin resistance protein  89.74 
 
 		 3135 bp  46.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  91.43 
 
 		 3114 bp  46.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2449  acriflavin resistance protein  91.43 
 
 		 3315 bp  46.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.302925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  89.74 
 
 		 3156 bp  46.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4183  acriflavin resistance protein  91.43 
 
 		 3135 bp  46.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0790325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  82.67 
 
 		 3201 bp  46.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  89.74 
 
 		 3111 bp  46.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  85.45 
 
 		 3303 bp  46.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  85.45 
 
 		 3303 bp  46.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2521  acriflavin resistance protein  91.43 
 
 		 3315 bp  46.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225998  normal  0.0602775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>