39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7204 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  77 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  58.43 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  58.73 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  62.72 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  58.68 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  55.28 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  46.55 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  47.57 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  44.21 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  54.08 
 
 		 346 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  52.58 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  53.09 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  49.22 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  48.44 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  47.69 
 
 		 290 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  46.52 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  46.43 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  46.45 
 
 		 276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  42.7 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  42.7 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  40.86 
 
 		 638 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  37.67 
 
 		 377 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  38.92 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  38.92 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  38.86 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  39.43 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  41.76 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  41.76 
 
 		 435 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  40.39 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1096 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  29.74 
 
 		 1364 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  32.68 
 
 		 783 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  34.4 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  30.34 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  34.07 
 
 		 871 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>