31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5486 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  100 
 
 		 350 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  66.2 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  67.24 
 
 		 353 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  67.33 
 
 		 353 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  66.76 
 
 		 353 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  55.24 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  54.39 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  54.43 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  47.91 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  42.17 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  48.08 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  39.5 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  43.79 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  43.48 
 
 		 357 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  33.62 
 
 		 590 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  31.52 
 
 		 594 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  33.44 
 
 		 575 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  29.6 
 
 		 587 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  31.35 
 
 		 453 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  26.5 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  25.17 
 
 		 467 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  27.37 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  24.45 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  24.81 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  32.43 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  21.48 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  23.26 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  22.55 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  21.23 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  24.14 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  37.04 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>