41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3583 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2339  HNH endonuclease  42.48 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  36.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  36.36 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 438 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  40 
 
 		 459 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 481 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 464 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  44.9 
 
 		 454 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 452 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  26.32 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  29.79 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 477 aa  44.3  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 427 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  29.17 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  37.1 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 465 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 427 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0294  Formamidopyrimidine-DNA glycolase  37.5 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  36.36 
 
 		 471 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 465 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 168 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 199 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 165 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  36.73 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 443 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  29.58 
 
 		 427 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  32.84 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>