56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1032 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  91.98 
 
 
349 aa  649    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  92.26 
 
 
349 aa  651    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  701    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  72.75 
 
 
353 aa  523  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  50.39 
 
 
414 aa  347  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  27.76 
 
 
355 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  25.21 
 
 
366 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  24.59 
 
 
357 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  24.72 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  22.22 
 
 
357 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  25.19 
 
 
391 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  22.54 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  25.36 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  21.72 
 
 
407 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  29.71 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  24.41 
 
 
330 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  33.12 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  25.47 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  36.84 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  20.54 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  23.44 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  36.59 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  31.14 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  29.59 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.34 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0554  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.21 
 
 
528 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479073  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  29.1 
 
 
295 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  21.03 
 
 
900 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  21.78 
 
 
914 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  21.03 
 
 
900 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.67 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  28.5 
 
 
310 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2306  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.32 
 
 
1078 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.85 
 
 
330 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.19 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  22.81 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  24.07 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  22.27 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  22.06 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  26.15 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  22.66 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0714  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 
1074 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.278068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  23.23 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1039  hypothetical protein  22.56 
 
 
449 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0121  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.58 
 
 
1075 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  22.41 
 
 
302 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  19.13 
 
 
393 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  22.27 
 
 
301 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  29.88 
 
 
419 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  22.28 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  22.94 
 
 
306 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  20.23 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.43 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.23 
 
 
301 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>